【第一參賽人/留學人員】李旦
【留學國家】美國
【技術領域】生物技術與大健康
【參賽屆次】第6屆
【所獲獎項】入圍
【項目簡介】
DNA甲基化是一種表觀調控修飾，它在不改變堿基序列的情況下，參與生物過程的各類調控。據臨床研究表明癌細胞也擁有一系列特殊的甲基化標記，形成了癌細胞獨有的甲基化ID。如果在血漿游離DNA（cfDNA）中搜尋這些ID，我們就有可能檢測到癌癥的存在，甚至是提前發現癌癥，這是利用血漿游離腫瘤DNA（ctDNA）甲基化進行癌癥早診的原理，也是本項目主要研究及攻破的重點。基于團隊之前研發的DNA和RNA免疫共沉淀方法基礎上，我們采用DNA甲基化的捕獲抗體將全基因組上的DNA甲基化特異區域進行集中富集，然后建庫、測序捕獲的甲基化DNA序列，通過生物信息學方法分析全基因組的甲基化趨勢，機器學習構建甲基化模型，確定腫瘤細胞發生區域及發生時期。此外，采用傳統的Bisulf-seq或者Bisulf-qPCR方法對該方法的結果進行驗證和優化。該方法計劃將在7個疾病部位（卵巢癌、前列腺癌、肺癌、乳腺癌、胰腺癌、結直腸癌、和膀胱癌）的患者腫瘤樣本和來自健康供者的樣本中進行檢測，分析血漿游離cfDNA的甲基化模式并用來追蹤癌癥起源和類型。
【展開】
【收起】